Cake/Core/App.php を読みます。 bootstrap.phpが呼び出されていた3つのファイルのうち2つ目です。 　

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require CAKE . 'basics.php';
require CAKE . 'Core' . DS . 'App.php';
require CAKE . 'Error' . DS . 'exceptions.php';

　 Appクラスの中身を見ていきますが、全部読むのは面倒なので、uses関数にしぼります。 ※他に大事な関数があれば、後で追記します。 　

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public static function uses($className, $location) {
    self::$_classMap[$className] = $location;
}

　 なんじゃそりゃ？という感じですが、読みましょう。 メンバ変数の$_classMap配列に$classNameというキーと、場所を$locationでセットします。 ∑(ﾟдﾟlll)ｶﾞｰﾝ、そんだけ。瞬時にロードされるかと思ったら違ってた。 App:usesしても、特に・・・なんすね。 　 実は、bootstrap.phpでは、App.phpをincludeした2行くらい下で、下記の記述があります。

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spl_autoload_register(array('App', 'load'));

CakePHPのファイルロードはここを理解すれば、大体把握できそうですね。 　 　 ちなみに、クラスの定義以外だと、Utility内のInflectorクラスを$_classMapへ設定しています。

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App::uses('Inflector', 'Utility');

うーむ、何故ここなのだろう・・。bootstrap.phpにはApp:usesを列挙している箇所があるので、そこでも良さそうだが・・・ 　 　 ひとまず、本日はApp:usesは、配列に値をセットするだけということが確認出来ました。